知网查重编码非法的原因主要包括：一、文本抄袭现象严重，导致编码不符合规范；二、使用非法工具进行查重，造成编码错误；三、文本未经授权擅自使用他人作品，违反相关法律法规。针对这些原因，建议加强文本原创性，使用正规查重工具，遵守版权法规。

知网查重编码非法可能导致的后果有：一、被他人指控侵犯知识产权，面临法律诉讼风险；二、影响学术声誉和研究成果的真实性；三、被知网等平台封禁或处罚，影响学术交流和发表渠道。因此，建议严格遵守学术道德规范，保证文本原创性，避免编码非法问题的发生。